Este é o maior terminal operado pela Transpetro. São Sebastião recebe petróleo por navio-petroleiro e abastece quatro refinarias do estado de São Paulo através dos oleodutos São Sebastião-Guararema e Santos-São Sebastião. Foram usadas esquadrias com micro persianas entre vidros com sistema a vácuo que evita a necessidade de limpeza e promove privacidade controlada.